Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
AknaQ80VW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
AknaQ80VW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AknaQ80VW7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
AknaQ80VW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms