Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnf1Q7TSH7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnf1Q7TSH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms