Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms