Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms