Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700010I14RikQ7TPG0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
1700010I14RikQ7TPG0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms