Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkd1l2Q7TN88 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms