Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp16Q7TMM8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp16Q7TMM8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms