Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms