Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy1Q76LS9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy1Q76LS9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy1Q76LS9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy1Q76LS9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy1Q76LS9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mindy1Q76LS9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms