Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms