Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sned1Q70E20 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms