Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Spcs3Q6ZWQ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Spcs3Q6ZWQ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spcs3Q6ZWQ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms