Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy1Q6ZQ11 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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