Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Glis3Q6XP49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms