Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Timd4Q6U7R4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms