Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms