Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4aQ6Q473 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms