Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms