Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim37Q6PCX9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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