Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhb9Q6PB60 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhb9Q6PB60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms