Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms