Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS41

Slc25a47, Solute carrier family 25 member 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a47Q6IS41 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc25a47Q6IS41 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a47Q6IS41 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms