Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6aQ6IE21 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms