Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KdsrQ6GV12 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KdsrQ6GV12 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms