Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn4Q69Z26 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn4Q69Z26 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms