Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf1Q64213 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf1Q64213 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms