Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr2kQ63871 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms