Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms