Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp1Q62209 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms