Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gli3Q61602 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms