Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsx2Q61412 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsx2Q61412 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms