Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igbp1Q61249 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igbp1Q61249 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igbp1Q61249 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms