Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Trpc6Q61143 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Trpc6Q61143 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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