Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms