Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms