Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms