Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms