Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf1Q60775 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf1Q60775 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf1Q60775 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf1Q60775 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elf1Q60775 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms