Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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NkaplQ5SZT7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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NkaplQ5SZT7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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NkaplQ5SZT7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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NkaplQ5SZT7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NkaplQ5SZT7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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NkaplQ5SZT7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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NkaplQ5SZT7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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NkaplQ5SZT7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NkaplQ5SZT7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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NkaplQ5SZT7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NkaplQ5SZT7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms