Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd40Q5SUE8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms