Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam71bQ5STT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam71bQ5STT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms