Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Utp18Q5SSI6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms