Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps41Q5KU39 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms