Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gm3558Q5FWC9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Gm3558Q5FWC9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3558Q5FWC9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Gm3558Q5FWC9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Gm3558Q5FWC9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gm3558Q5FWC9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gm3558Q5FWC9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gm3558Q5FWC9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm3558Q5FWC9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3558Q5FWC9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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