Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms