Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms