Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brinp3Q499E0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms