Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms