Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim26Q3V460 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms