Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700057G04RikQ3V0U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms